السلام عليكم
اختي العزيزة بالنسبه لحجم الموظفين يجب اولا تهئية كل تلك البيانات و الملفات في داتا مدخله علي برامج قواعد البيانات اكسل مثلا او داتا بيز

انا انصح بتقسيم الفايلات بحسب الادارات و الاشخاص في كل اداره بالسريال
ثم بالنسبه للملفات الاخري مثل تشيك ليست او اتش ار ليتر فورم اضعها في ملف يسمي reports and form
ملفات البريفورمنس ابريزل توضع في ملف خاص و بالتالي اي موضوع يتم تقسمه

....
اخيرا انصحكم بالتعاقد مع شركة تقنيه برمجيه لتصميم برنامج يتخصص بتلك العلميه لقسم ال HR و هناك العديد من البرامج الاجنبيه الموجوده. لكن انصح بشركه تصمم لكم البرنامج ليتيح لكم تصميم البرنامج بما يتناسب مع تعداد الموظفين و نوعيه الملفات الخاصه بهم.

و الله الموفق